擬南芥和線蟲(chóng)外顯子/內(nèi)含子剪切位點(diǎn)的研究

擬南芥和線蟲(chóng)外顯子/內(nèi)含子剪切位點(diǎn)的研究

將擬南芥(A.thaliana)和線蟲(chóng)(C.elegans)的基因序列中的外顯子按第一外顯子,中間外顯子和最后外顯子劃分成三類.分別將外顯子/內(nèi)含子剪切位點(diǎn)、翻譯起始和終止位點(diǎn)附近的三聯(lián)體的3個(gè)位點(diǎn)作為3條子鏈,以各條子鏈的不同堿基個(gè)數(shù)作為離散源參數(shù),共12個(gè)離散源參數(shù),計(jì)算各類外顯子離散量.用離散增量實(shí)現(xiàn)了對(duì)三種序列類型的預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)成功率都達(dá)到80%以上;并且統(tǒng)計(jì)了剪切位點(diǎn)附近的堿基相對(duì)頻數(shù),結(jié)果比較了由于三聯(lián)體所取位置及個(gè)數(shù)不同而造成的對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果的差異,說(shuō)明了剪切位點(diǎn)附近堿基的保守性.

作 者： 林昊 李前忠 LIN Hao LI Qian-zhong   作者單位： 內(nèi)蒙古大學(xué)理工學(xué)院物理系,呼和浩特,010021  刊 名： 內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NEIMONGOL  年，卷(期)： 2006 37(3)  分類號(hào)： Q61  關(guān)鍵詞： 外顯子   離散增量   剪切位點(diǎn)   保守性  

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