一個水稻穗特異表達鋅指蛋白基因的克隆與結(jié)構(gòu)分析

一個水稻穗特異表達鋅指蛋白基因的克隆與結(jié)構(gòu)分析

利用生物信息學(xué)和RT-PCR方法從水稻中克隆鑒定了一個新的具有TFⅢA型鋅指結(jié)構(gòu)的鋅指蛋白基因,其開放閱讀框為1092 bp,編碼363個氨基酸殘基.組織表達譜結(jié)果表明,該基因只在水稻幼穗組織中表達,在成株期的根、葉、莖以及花藥中不表達,將其命名為OsZPT3-1.序列分析表明OsZPT3-1具有3個C2H2型鋅指結(jié)構(gòu),在氨基酸的C端沒有典型的轉(zhuǎn)錄抑制區(qū)域DLN-box,但LXLXL的結(jié)構(gòu)仍然表明OsZPT3-1可能是一個轉(zhuǎn)錄抑制因子.對OsZPT3-1啟動子區(qū)域進行預(yù)測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)3個MADS-box轉(zhuǎn)錄因子識別位點,推測OsZPT3-1可能在MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)節(jié)下,通過抑制下游基因的表達在水稻穗部器官的生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用.

作 者： 李余生 黃驥 禹山林 侯夫云 張紅生 LI Yu-sheng HUANG Ji YU Shan-lin HOU Fu-yun ZHANG Hong-sheng   作者單位： 南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點實驗室,江蘇 南京 210095  刊 名： 中國水稻科學(xué)  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE  年，卷(期)： 2006 20(4)  分類號： Q943.2 S511.032  關(guān)鍵詞： 水稻   鋅指蛋白   基因克隆   表達分析  

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