真雙子葉基部類群十種植物的CHS基因家族成員分析

真雙子葉基部類群十種植物的CHS基因家族成員分析

用PCR方法從目前極少被報(bào)道的真雙子葉基部類群10種植物的總DNA中擴(kuò)增出CHS基因外顯子2的部分序列進(jìn)行分析,經(jīng)克隆后測序,共得到26個(gè)不同的片段.分析表明,所有序列具有較高的同源性(＞ 70%),每種植物有2～4個(gè)不同的拷貝,在金魚藻中發(fā)現(xiàn)有一個(gè)拷貝(CedeCHS3)含有一段長29個(gè)堿基的缺失,可能已失去了該基因的功能,而來自銀樺的GrroCHS8拷貝具有較多活性位點(diǎn)的變異,可能具有了新的功能.在對堿基含量的分析中表明,只有來自雀舌黃楊的序列有一定的GC偏好,特別是第三位的GC含量達(dá)70%以上.用貝葉斯法、最大簡約法和鄰接法構(gòu)建的CHS基因的分子系統(tǒng)樹均由3個(gè)主要分支構(gòu)成,其中一個(gè)分支由來自金魚藻的4個(gè)序列聚在一起構(gòu)成了sulfamily Ⅱ,來自昆欄樹的2個(gè)序列聚在一起網(wǎng)接于subfamilyⅢ中;來自獨(dú)葉草的3個(gè)序列分散于同一亞家族(subfamily Ⅰ)的不同分支中;而多數(shù)種的序列分散在相距較遠(yuǎn)的兩個(gè)分支中,構(gòu)成了兩個(gè)主要的亞家族subfamilyⅠ、subfamily Ⅲ.從所建分子系統(tǒng)樹看真雙子葉基部類群植物的CHS基因家族成員來源于該類群形成前的兩個(gè)祖先拷貝,在不同植物這兩個(gè)祖先拷貝經(jīng)歷了不同的進(jìn)化過程,這些進(jìn)化上的差異可能與不同植物的生活習(xí)性及生存環(huán)境的多樣性相關(guān).

作 者： 楊俊波 楊漢奇 李德銖 李洪濤 YANG Jun-Bo YANG Han-Qi LI De-Zhu LI Hong-Tao   作者單位： 中國科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性和生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南,昆明,650204  刊 名： 云南植物研究  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA  年，卷(期)： 2006 28(4)  分類號： Q945  關(guān)鍵詞： 真雙子葉基部類群   查爾酮合酶基因家族   進(jìn)化   重復(fù)  

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