三種鱉線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列的比較分析

三種鱉線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列的比較分析

對(duì)中華鱉、砂鱉和山瑞鱉線粒體DNA細(xì)胞色素b基因進(jìn)行了引物設(shè)計(jì)、PCR擴(kuò)增、序列測(cè)定和PCR-PFLP(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)分析.研究結(jié)果表明中華鱉、砂鱉與山瑞鱉線粒體DNA Cytb基因的序列全長(zhǎng)相同,均為1140bp,其A、C、G、T含量相似,分別為378個(gè)(33.2%)、322個(gè)(28.2%)、122個(gè)(10.7%)、318個(gè)(27.9%)、373個(gè)(32.7%)、324個(gè)(28.4%)、124個(gè)(10.9%)、319個(gè)(28.0%)、380個(gè)(33.3%)、330個(gè)(28.9%)、127個(gè)(11.1%)、303個(gè)(26.7%).同源性及序列差異率分析表明:中華鱉與砂鱉b基因序列的同源性為92.3%,中華鱉、山瑞鱉的為85.0%,砂鱉、山瑞鱉的為84.1%;中華鱉與砂鱉b基因核苷酸序列間的差異率為7.7%,中華鱉、山瑞鱉間的序列差異率為15.0%,砂鱉、山瑞鱉間的序列差異率為15.9%,而中華鱉、砂鱉、山瑞鱉各自個(gè)體間的序列差異率分別為2.37%、0.88%和0.18%,種間差異顯著.用內(nèi)切酶酶切分析其擴(kuò)增產(chǎn)物,結(jié)果表明:用內(nèi)切酶Nde Ⅰ可準(zhǔn)確鑒別砂鱉,而用內(nèi)切酶BamHⅠ則可準(zhǔn)確鑒別山瑞鱉.內(nèi)切酶NdeⅠ和BamHⅠ的聯(lián)用分析,可使這三種鱉在分子水平都得到明確的鑒定.從三種鱉線粒體DNA Cytb基因核苷酸序列的顯著差異和酶切位點(diǎn)的變化,可以進(jìn)一步證明砂鱉是不同于中華鱉的鱉屬一新種.

作 者： 陳合格 劉文彬 李建中 張軒杰 CHEN He-Ge LIU Wen-Bin LI Jian-Zhong ZHANG Xuan-Jie   作者單位： 湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,長(zhǎng)沙,410081  刊 名： 水生生物學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2006 30(4)  分類號(hào)： Q173  關(guān)鍵詞： 中華鱉   砂鱉   山瑞鱉   細(xì)胞色素b   PCR-RFLP分析   分子鑒定標(biāo)記  

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