河豚白介素2基因鑒定及其生物信息學(xué)分析

河豚白介素2基因鑒定及其生物信息學(xué)分析

利用比較基因組學(xué)方法,在河豚(Fugu rubripes)基因組中鑒定了IL-2基因(FrIL-2).該基因?yàn)閱慰截惢��?其結(jié)構(gòu)、染色體定位均和人等高等動(dòng)物一致,但基因非常精簡.基因上游調(diào)控區(qū)含眾多轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),3'UTR含poly(A)加尾信號(hào)和8個(gè)細(xì)胞因子類普遍存在的轉(zhuǎn)錄不穩(wěn)定序列;FrIL-2基因編碼149個(gè)氨基酸,N端含22個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽,肽鏈內(nèi)含8個(gè)Cys,其中和生物學(xué)活性相關(guān)的Cys-66和Cys-116高度保守,在結(jié)構(gòu)上存在一個(gè)類似IL-2特征性功能域結(jié)構(gòu),此外還存在一些修飾位點(diǎn)如N-糖基化位點(diǎn)和N端酰基化位點(diǎn).比較河豚與人、哺乳動(dòng)物、鳥類等IL-2的同源性,其氨基酸序列相似性為25%～34%.研究結(jié)果為今后利用魚類基因組數(shù)據(jù)庫和生物信息學(xué)快速鑒定新的魚類功能基因打下了方法學(xué)基礎(chǔ),也為進(jìn)一步開展魚類IL-2基因功能研究提供了科學(xué)依據(jù).

作 者： 董偉仁 邵健忠 項(xiàng)黎新 DONG Wei-ren SHAO Jian-zhong XIANG Li-xin   作者單位： 浙江大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,浙江,杭州,310012  刊 名： 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)（理學(xué)版）  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY (SCIENCE EDITION)  年，卷(期)： 2006 33(6)  分類號(hào)： Q952.5  關(guān)鍵詞： 河豚   IL-2基因   鑒定   比較基因組學(xué)  

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