高溫環(huán)境樣品總DNA直接和間接提取方法的比較

高溫環(huán)境樣品總DNA直接和間接提取方法的比較

分別采用兩種環(huán)境總DNA直接提取法和一種間接提取法從6種溫泉菌席樣品中提取總DNA,以DNA粗產物的純度、能否用于后續(xù)PCR擴增及PCR-DGGE(變性梯度凝膠電泳)所反映的微生物多樣性為評價指標對兩類方法進行比較和評價.研究發(fā)現,雖然間接提取法效率低下,但對于高溫極端環(huán)境中生物量較小的樣品,間接法能得到有研究價值的、純度較高的環(huán)境樣品總DNA,而直接法得到的DNA量小且不適于PCR擴增操作.在使用這2類方法都能得到可用于研究操作的DNA的情況下,間接提取法能更好的體現環(huán)境樣品中微生物的多樣性.

作 者： 劉宏偉 彭謙 李沁元 肖煒 崔曉龍 林連兵 劉志堅 姜成林 徐麗華 陳義光 王治剛 任禛 鄧嵐 文孟良   作者單位： 劉宏偉,彭謙,肖煒,崔曉龍,劉志堅,姜成林,徐麗華,陳義光,王治剛,任禛,鄧嵐,文孟良(云南大學,云南省微生物研究所,云南省生物資源保護與利用重點實驗室,昆明,650091)

李沁元(云南大學生命科學教學實驗中心,昆明,650091)

林連兵(昆明理工大學生物與化學工程學院,昆明,650224) 

刊 名： 微生物學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA MICROBIOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2006 46(6)  分類號： Q93  關鍵詞： 菌席   環(huán)境DNA   間接DNA提取法   PCR-DGGE  

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