基于小波分析的蛋白質(zhì)序列分形研究

基于小波分析的蛋白質(zhì)序列分形研究

利用氨基酸的疏水自由能對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行編碼,選擇墨西哥帽小波對于編碼序列進(jìn)行多尺度分解,應(yīng)用基于小波分解的Abry-Veitch算法來研究蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的分形特性,最后通過計算Hurst指數(shù)來定量刻畫蛋白質(zhì)序列的自相似性.實驗結(jié)果表明.本文的方法只依據(jù)蛋白質(zhì)一級序列的信息,可獲得反映了蛋白質(zhì)序列排列的自相似性和復(fù)雜度一個判據(jù),相比于其他方法,本文的方法簡單、可靠,為蛋白質(zhì)序列的分析和研究提供了一個新的思路.

作 者： 湯麗華   作者單位： 南京郵電大學(xué)地理與生物信息學(xué)院,江蘇,南京,210003  刊 名： 科技信息  英文刊名： SCIENCE & TECHNOLOGY INFORMATION  年，卷(期)： 2009 ""(33)  分類號： Q5  關(guān)鍵詞： Abry-Veitch算法   Hurst指數(shù)   墨西哥帽小波   分形  

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