暗紋東方鲀線粒體COI及其側(cè)翼tRNA基因的克隆與序列分析

暗紋東方鲀線粒體COI及其側(cè)翼tRNA基因的克隆與序列分析

以暗紋東方鲀(Takifugu fasciatus)肝臟的線粒體DNA為模板,按照紅鰭東方鲀線粒體DNA序列設(shè)計(jì)合成特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,克隆并測(cè)定了線粒體細(xì)胞色素氧化酶I亞基(COI)及其側(cè)翼tRNA基因的全序列,結(jié)果顯示,克隆了暗紋東方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp.用DNA分析軟件對(duì)暗紋東方鲀與GenBank中10個(gè)目14種魚類的COI序列進(jìn)行比較分析,顯示暗紋東方鲀與這些魚類的COI基因具有較高的同源性,與同屬紅鰭東方鲀的同源性最高為97.6%,與同目不同科的矛尾翻車鲀和翻車鲀的同源性為76.5%和75.4%.根據(jù)暗紋東方鲀與其他1 314種魚的COI基因序列同源性所建立的進(jìn)化樹,與傳統(tǒng)的分類地位基本吻合.推定的這兩種tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)都具有典型的三葉草型結(jié)構(gòu).

作 者： 邵愛華 朱江 陳葵 史全良 姚煒雯 SHAO Ai-Hua ZHU Jiang CHEN Kui SHI Quan-Liang YAO Wei-Wen   作者單位： 邵愛華,SHAO Ai-Hua(江蘇省蘇州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,蘇州,215123;江蘇省蘇州科技學(xué)院生物學(xué)系,蘇州,215009)

朱江,陳葵,史全良,姚煒雯,ZHU Jiang,CHEN Kui,SHI Quan-Liang,YAO Wei-Wen(江蘇省蘇州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,蘇州,215123) 

刊 名： 遺傳  ISTIC PKU 英文刊名： HEREDITAS(BEIJING)  年，卷(期)： 2006 28(8)  分類號(hào)： Q95  關(guān)鍵詞： 暗紋東方鲀   線粒體DNA   COI   系統(tǒng)學(xué)  

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