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基于PNO基因序列分析隱孢子蟲種系發(fā)育關系
本文以核基因組的功能蛋白丙酮酸:NADP+氧化還原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)編碼基因作為研究對象,對本實驗室分離保存的隱孢子蟲蟲株進行擴增測序,用ClustalX 1.81對擴增序列與GenBank相關參考序列進行比對,用Paup4.0程序中鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大簡約法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)進行聚類分析,以確定不同隱孢子蟲分離株之間的遺傳進化關系,并以18S rRNA和HSP70基因構僵的基因樹作參照,進而評價PNO這一基因座是否適合作為隱孢子蟲基因分型和進化關系分析的基因座.結果表明通過PNO構建的進化樹將隱孢子蟲分為2大類:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis處于一個分枝,C.hominis、C.parvum�；蛐秃虲.parvum鼠基因型處于另一個分枝上.不同隱孢子蟲之間的同源性介于95.0%～100%,能有效區(qū)分隱孢子蟲不同基因型.因此,PNO基因序列也適合作為隱孢子蟲分離株種系發(fā)育的遺傳標記.
作 者： 王進產(chǎn) 張龍現(xiàn) 趙金鳳 寧長申 菅復春 WANG Jin-Chan ZHANG Long-Xian ZHAO Jin-Feng NING Chang-Shen JIAN Fu-Chun 作者單位： 王進產(chǎn),WANG Jin-Chan(河南農(nóng)業(yè)大學牧醫(yī)工程學院,鄭州,450002;洛陽普萊柯生物工程有限公司,河南洛陽,471000)張龍現(xiàn),趙金鳳,寧長申,菅復春,ZHANG Long-Xian,ZHAO Jin-Feng,NING Chang-Shen,JIAN Fu-Chun(河南農(nóng)業(yè)大學牧醫(yī)工程學院,鄭州,450002)
刊 名： 寄生蟲與醫(yī)學昆蟲學報 ISTIC 英文刊名： ACTA PARASITOLOGICA ET MEDICA ENTOMOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 2008 15(1) 分類號： Q96 關鍵詞： 隱孢子蟲 丙酮酸 NADP+氧化還原酶 基因分型 種系發(fā)育關系【基于PNO基因序列分析隱孢子蟲種系發(fā)育關系】相關文章：
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