一種快速比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型相似性的方法

一種快速比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型相似性的方法

根據(jù)相同立體結(jié)構(gòu)中的各部分只需一個(gè)旋轉(zhuǎn)矩陣就能將兩者疊合在一起的基本原理,對(duì)原有的結(jié)構(gòu)比較方法作了改進(jìn),使其比較速度得到很大提高.尤其是對(duì)相似蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的比較,速度的提高更為顯著.由于在蛋白質(zhì)天然構(gòu)象的一致性分析中,模型結(jié)構(gòu)之間的比較是其計(jì)算時(shí)間的瓶頸,因此本法對(duì)提高一致分析方法的計(jì)算效率有著重要的意義.

作 者： 徐建平 方慧生 相秉仁 XU Jian-ping FANG Hui-sheng XIANG Bin-ren   作者單位： 徐建平,相秉仁,XU Jian-ping,XIANG Bin-ren(中國(guó)藥科大學(xué)分析測(cè)試中心)

方慧生,FANG Hui-sheng(中國(guó)藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,南京,210009) 

刊 名： 中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF CHINA PHARMACEUTICAL UNIVERSITY  年，卷(期)： 2006 37(3)  分類號(hào)： Q518.2  關(guān)鍵詞： 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)   旋轉(zhuǎn)矩陣   蛋白質(zhì)模型比較  

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