- 相關(guān)推薦
哺乳動物驅(qū)動蛋白的計算基因組學分析與鑒定
提供了一種新穎的、基于比較基因組學方法的全長驅(qū)動蛋白預測方法(full-length kinesin prediction program,FKPP),用于哺乳動物中驅(qū)動蛋白質(zhì)組的鑒定與研究.之前的預測認為,哺乳動物共含94個驅(qū)動蛋白,而用FKPP從哺乳動物的基因組中總共鑒定出134個可能的驅(qū)動蛋白基因.基于數(shù)據(jù)庫中存在的片段序列,用FKPP鑒定出25個可能的全長驅(qū)動蛋白.此外,用FKPP方法發(fā)現(xiàn)人的動點馬達蛋白CENP-E應包含2701個氨基酸,而不是當初根據(jù)克隆預測的2663個氨基酸.通過對CENP-E的cDNA進行重測序,并同時采用特異性識別FKPP預測的CENP-E多肽抗體予以實驗評估,結(jié)果表明,FKPP預測的CENP-E氨基酸序列是正確的.為此,本研究利用FKPP對哺乳動物的驅(qū)動蛋白進行了重新分類.鑒于目前公共數(shù)據(jù)庫含有較多非全長序列的蛋白片段,FKPP可提供一個具有顯著效率且準確新穎的全長序列預測手段,用于驅(qū)動蛋白以及其他蛋白家族的分子鑒定.
作 者： 薛宇 劉丹 符傳孩 竇震 周慶 姚雪彪 作者單位： 薛宇,劉丹,符傳孩,竇震,姚雪彪(中國科學技術(shù)大學細胞動力學實驗室及合肥微尺度物質(zhì)科學國家實驗室,合肥,230027)周慶(中國科學技術(shù)大學細胞動力學實驗室及合肥微尺度物質(zhì)科學國家實驗室,合肥,230027;浙江大學農(nóng)學院,杭州,310003)
刊 名： 科學通報 ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE SCIENCE BULLETIN 年，卷(期)： 2006 51(14) 分類號： Q95 關(guān)鍵詞： 驅(qū)動蛋白 比較基因組學 CENP-E 全長驅(qū)動蛋白預測方法(FKPP)【哺乳動物驅(qū)動蛋白的計算基因組學分析與鑒定】相關(guān)文章：
成本計算與分析實訓報告10-21
蛋白質(zhì)04-07
任務驅(qū)動型作文05-10
形狀記憶合金驅(qū)動薄壁圓管扭轉(zhuǎn)變形分析及試驗研究論文（精選6篇）12-22
蛋白提取實驗步驟03-21
蛋白質(zhì)的教案及反思04-25
計算機專業(yè)實習鑒定11-30
領域驅(qū)動設計之體會二04-25
高蛋白食物有哪些03-03